Блог

May 03, 2023

Приобретение и носительство генетически разнообразных мульти

Коммуникационная медицина

Коммуникационная медицина, том 3, Номер статьи: 79 (2023) Цитировать эту статью

166 Доступов

1 Альтметрика

Подробности о метриках

В этом подробном геномном исследовании охарактеризовано носительство грамотрицательных бацилл с множественной лекарственной устойчивостью (MDR-GNB) у новорожденных весом < 2 кг и парных матерей в африканской больнице с низкими ресурсами.

Это перекрестное когортное исследование было проведено в неонатальном отделении в Гамбии с еженедельным отбором проб кожи новорожденных и перианальных проб и парными ректовагинальными мазками у матери. Для проспективной бактериологической культуры использовали агар МакКонки с видовой идентификацией по API20E и API20NE. Все изоляты GNB прошли полногеномное секвенирование на платформе Illumina Miseq. Мультилокусное типирование последовательностей и анализ SNP-расстояний определили тип штамма и родство.

Из 135 мазков от 34 новорожденных и 21 парной матери было получено 137 изолятов GNB, из которых 112 представляют собой высококачественные образования de novo. Распространенность неонатального носительства МЛУ-ГНБ составляет 41% (14/34) при поступлении и 85% (11/13) новых случаев заболевания к 7-му дню. Множественные виды MDR и ESBL-GNB переносятся в разные моменты времени, чаще всего K. pneumoniae и E. coli, с гетерогенным разнообразием штаммов и без признаков клональности. 111 различных генов устойчивости к антибиотикам в основном представляют собой бета-лактамазы (Bla-AMPH, Bla-PBP, CTX-M-15, Bla-TEM-105). У 76% (16/21) и 62% (13/21) матерей имеется ректовагинальное носительство ≥1 MDR-GNB и ESBL-GNB соответственно, преимущественно MDR-E. coli (76%, 16/21) и MDR-K. pneumoniae (24%, 5/21). Из 21 пары новорожденный-мать только одна имеет генетически идентичные изоляты (E. coli ST131 и K. pneumoniae ST3476).

Госпитализированные новорожденные в Гамбии демонстрируют высокую распространенность носительства МЛУ и БЛРС-ГНБ с заражением в период от рождения до 7 дней с ограниченными данными, подтверждающими передачу инфекции от матери новорожденному. Геномные исследования в аналогичных условиях необходимы для дальнейшего понимания передачи и обоснования политики целевого надзора и профилактики инфекций.

Бактерии, устойчивые к нескольким антибиотикам, являются важной причиной инфекций и смертности новорожденных в странах с низкими ресурсами, особенно маленьких или недоношенных детей, рожденных в больницах. Каким образом эти устойчивые бактерии попадают на кожу и в кишечнике новорожденных, неизвестно, в частности, обычно ли они передаются от матерей. Мы изучили бактерии, присутствующие у маленьких новорожденных в Гамбии и их матерях, чтобы понять тип бактерий, степень устойчивости к антибиотикам, количество пострадавших новорожденных и матерей, а также сходство этих бактерий у новорожденных и их матерей. Мы обнаружили, что, несмотря на то, что многие новорожденные являются носителями этих бактерий, они отличаются от тех, которые присутствуют у матерей. Это говорит о том, что бактерии занесены из больничной среды. Наше исследование подчеркивает важность разработки стратегий по выявлению и уменьшению присутствия таких бактерий в больницах, чтобы уменьшить их заражение уязвимыми госпитализированными новорожденными.

Неонатальная смертность остается неприемлемо высокой во многих странах Африки и Азии, составляя 47% смертей детей в возрасте до 5 лет1. Инвазивные инфекции являются важной причиной неонатальной смертности, с тяжелым бременем в Африке и высоким относительным риском смертности2,3. Маленькие уязвимые новорожденные, рожденные недоношенными (<37 недель беременности) и/или с низкой массой тела при рождении (LBW; <2,5 кг), подвергаются наибольшему риску инфекций из-за нарушения врожденного и адаптивного иммунитета4, длительного пребывания в больнице и инвазивных процедур5. Кишечное носительство патогенов с транслокацией через стенку кишечника связано с поздним началом инфекций и воспалительных заболеваний6, а целостность кожи недоношенных детей обычно нарушается, что обеспечивает дополнительный путь для инвазивной инфекции.

По оценкам, 31% из 690 000 ежегодных случаев смерти новорожденных, связанных с сепсисом, потенциально могут быть связаны с устойчивостью к противомикробным препаратам (УПП)7. Среди грамотрицательных бактерий (ГНБ) Enterobacterales являются основной причиной тяжелых бактериальных инфекций у африканских новорожденных2,8,9, при этом наиболее часто вовлекаются Klebsiella pneumoniae и Escherichia coli. Множественная лекарственная устойчивость (МЛУ) наблюдается в 82% случаев инвазивного неонатального ГНБ в Африке10,11, при этом распространенность увеличивается11, а лечение затруднено из-за ограниченных возможностей диагностики и лечения7. В 2017 году Всемирная организация здравоохранения включила GNB, продуцирующий бета-лактамазы расширенного спектра (ESBL), в список высокоприоритетных патогенов для исследований и разработки антибиотиков. К 2030 году должно быть достигнуто менее 12/1000 живорождений13.